Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KCNC2Q96PR1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KCNC2Q96PR1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KCNC2Q96PR1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KCNC2Q96PR1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms