Protein–RNA interactions for Protein: Q96G97

BSCL2, Seipin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSCL2Q96G97 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BSCL2Q96G97 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BSCL2Q96G97 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BSCL2Q96G97 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BSCL2Q96G97 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BSCL2Q96G97 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BSCL2Q96G97 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms