Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC47Q96A33 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC47Q96A33 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC47Q96A33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC47Q96A33 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.9 ms