Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIM63Q969Q1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM63Q969Q1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM63Q969Q1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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