Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRTOMTQ8WZ04 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRTOMTQ8WZ04 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRTOMTQ8WZ04 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRTOMTQ8WZ04 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms