Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG1Q8WTW3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG1Q8WTW3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG1Q8WTW3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG1Q8WTW3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COG1Q8WTW3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
COG1Q8WTW3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG1Q8WTW3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COG1Q8WTW3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG1Q8WTW3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG1Q8WTW3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COG1Q8WTW3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COG1Q8WTW3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG1Q8WTW3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COG1Q8WTW3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COG1Q8WTW3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms