Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC4DQ8WTU2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC4DQ8WTU2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC4DQ8WTU2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC4DQ8WTU2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSC4DQ8WTU2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC4DQ8WTU2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSC4DQ8WTU2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC4DQ8WTU2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC4DQ8WTU2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSC4DQ8WTU2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSC4DQ8WTU2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC4DQ8WTU2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSC4DQ8WTU2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSC4DQ8WTU2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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