Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C5orf17Q8NAS9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C5orf17Q8NAS9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C5orf17Q8NAS9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C5orf17Q8NAS9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C5orf17Q8NAS9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C5orf17Q8NAS9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C5orf17Q8NAS9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C5orf17Q8NAS9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C5orf17Q8NAS9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C5orf17Q8NAS9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C5orf17Q8NAS9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C5orf17Q8NAS9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms