Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNPLA1Q8N8W4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PNPLA1Q8N8W4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PNPLA1Q8N8W4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA1Q8N8W4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms