Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP9Q8IXQ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PARP9Q8IXQ6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP9Q8IXQ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP9Q8IXQ6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms