Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM139Q8IV31 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM139Q8IV31 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM139Q8IV31 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMEM139Q8IV31 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms