Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTF1AQ7RTS3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PTF1AQ7RTS3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PTF1AQ7RTS3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PTF1AQ7RTS3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PTF1AQ7RTS3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.3 ms