Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHMP1BQ7LBR1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMP1BQ7LBR1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMP1BQ7LBR1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1123.9 ms