Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMR5

TMPRSS11A, Transmembrane protease serine 11A, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11AQ6ZMR5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11AQ6ZMR5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11AQ6ZMR5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TMPRSS11AQ6ZMR5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS11AQ6ZMR5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 771.4 ms