Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC36A4Q6YBV0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC36A4Q6YBV0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC36A4Q6YBV0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC36A4Q6YBV0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms