Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
E4F1Q66K89 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
E4F1Q66K89 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
E4F1Q66K89 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E4F1Q66K89 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms