Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C1orf53Q5VUE5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
C1orf53Q5VUE5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
C1orf53Q5VUE5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1orf53Q5VUE5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms