Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VAX1Q5SQQ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VAX1Q5SQQ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VAX1Q5SQQ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms