Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TBRG1Q3YBR2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TBRG1Q3YBR2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TBRG1Q3YBR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TBRG1Q3YBR2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms