Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CUL1Q13616 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CUL1Q13616 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CUL1Q13616 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CUL1Q13616 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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