Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SMAD4Q13485 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMAD4Q13485 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMAD4Q13485 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMAD4Q13485 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
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