Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.174e-7■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 HNRNPLL-201ENST00000272249 2190 ntTSL 25.71□□□□□ -1.54e-7■■■■■ 30.9
ILF3Q12906 HNRNPLL-210ENST00000488099 544 ntTSL 34.65□□□□□ -1.674e-7■■■■■ 30.9
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ILF3Q12906 XRCC2-201ENST00000359321 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.999e-14■■■■■ 30.8
ILF3Q12906 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.169e-7■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.165e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 QKI-204ENST00000361758 6085 ntTSL 522.16■■□□□ 1.145e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 WDR73-215ENST00000560182 542 ntTSL 421.95■■□□□ 1.15e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 ZNF346-210ENST00000513587 977 ntTSL 220.7■□□□□ 0.95e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.815e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 ZNF346-206ENST00000508155 1622 ntTSL 220.09■□□□□ 0.815e-9■■■■■ 30.6
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ILF3Q12906 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.625e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.625e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 WDR73-208ENST00000559126 2031 ntTSL 218.59■□□□□ 0.575e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.545e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 CRKL-202ENST00000411769 2037 ntTSL 1 (best)18.36■□□□□ 0.535e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.45e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.315e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 WDR73-205ENST00000558521 997 ntTSL 316.84■□□□□ 0.295e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 WDR73-210ENST00000559224 788 ntTSL 516.84■□□□□ 0.295e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 WDR73-211ENST00000559452 1240 ntTSL 315.64■□□□□ 0.095e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.095e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 WDR73-213ENST00000559994 2063 ntTSL 514.79□□□□□ -0.045e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 WDR73-207ENST00000559015 2140 ntTSL 214.65□□□□□ -0.065e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.085e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.115e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 WDR73-201ENST00000398528 1915 ntTSL 1 (best)13.51□□□□□ -0.255e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.45e-9■■■■■ 30.6
ILF3Q12906 WDR73-218ENST00000560966 5071 ntTSL 212.33□□□□□ -0.445e-9■■■■■ 30.6
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ILF3Q12906 ANKHD1-209ENST00000431508 4079 ntTSL 26.71□□□□□ -1.345e-9■■■■■ 30.6
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ILF3Q12906 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.3□□□□□ -1.46e-27■■■■■ 30.5
ILF3Q12906 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.632e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 PSMD8-204ENST00000591216 611 ntTSL 317.78■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-9■■■■■ 30.4
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ILF3Q12906 UBE3C-207ENST00000494532 543 ntTSL 213.78□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 PSMD8-205ENST00000591250 578 ntTSL 312.5□□□□□ -0.412e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 ACACA-234ENST00000614482 2177 ntTSL 211.4□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 PSMD8-208ENST00000592561 771 ntTSL 210.76□□□□□ -0.692e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.752e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 UBE3C-205ENST00000470408 5197 ntTSL 29.53□□□□□ -0.882e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 ACACA-245ENST00000619546 5315 ntTSL 1 (best)8.96□□□□□ -0.972e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 PSMD8-206ENST00000592001 853 ntTSL 28.18□□□□□ -1.12e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.252e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.342e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.42e-9■■■■■ 30.4
ILF3Q12906 PKM-209ENST00000563986 825 ntTSL 211.93□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 30.3
ILF3Q12906 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 30.3
ILF3Q12906 PKM-225ENST00000570166 626 ntTSL 26.62□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 30.3
ILF3Q12906 ZBTB34-201ENST00000319119 6564 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.694e-8■■■■■ 30.3
ILF3Q12906 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 30.2
ILF3Q12906 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 30.2
ILF3Q12906 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.551e-7■■■■■ 30.2
ILF3Q12906 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 30.2
ILF3Q12906 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -01e-7■■■■■ 30.2
ILF3Q12906 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 30.2
ILF3Q12906 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 30.2
ILF3Q12906 RBPMS-205ENST00000517860 1076 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 30.2
ILF3Q12906 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.563e-8■■■■■ 30.2
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