Protein–RNA interactions for Protein: Q08AN1

ZNF616, Zinc finger protein 616, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF616Q08AN1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF616Q08AN1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF616Q08AN1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF616Q08AN1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms