Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBL2Q08999 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBL2Q08999 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RBL2Q08999 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RBL2Q08999 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms