Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKCQQ04759 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCQQ04759 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCQQ04759 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKCQQ04759 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKCQQ04759 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms