Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFITM3Q01628 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IFITM3Q01628 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IFITM3Q01628 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFITM3Q01628 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFITM3Q01628 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms