Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3BP2P78314 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP2P78314 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2P78314 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP2P78314 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms