Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SUMO1P63165 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SUMO1P63165 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SUMO1P63165 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SUMO1P63165 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms