Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTR3P61158 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACTR3P61158 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTR3P61158 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTR3P61158 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms