Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GSDMDP57764 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GSDMDP57764 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GSDMDP57764 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GSDMDP57764 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GSDMDP57764 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GSDMDP57764 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GSDMDP57764 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GSDMDP57764 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GSDMDP57764 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GSDMDP57764 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GSDMDP57764 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GSDMDP57764 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.8 ms