Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLNS1AP54105 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLNS1AP54105 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLNS1AP54105 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLNS1AP54105 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms