Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GTF2A1P52655 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2A1P52655 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2A1P52655 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2A1P52655 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms