Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
IQGAP1P46940 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
IQGAP1P46940 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
IQGAP1P46940 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
IQGAP1P46940 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
IQGAP1P46940 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
IQGAP1P46940 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
IQGAP1P46940 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms