Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EIF4A3P38919 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EIF4A3P38919 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EIF4A3P38919 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EIF4A3P38919 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EIF4A3P38919 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms