Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNNB1P35222 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNNB1P35222 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTNNB1P35222 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTNNB1P35222 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms