Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXD11P31277 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HOXD11P31277 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HOXD11P31277 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD11P31277 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms