Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GADD45AP24522 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GADD45AP24522 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45AP24522 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GADD45AP24522 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms