Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBG1P23258 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TUBG1P23258 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBG1P23258 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBG1P23258 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms