Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB3BP20337 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB3BP20337 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3BP20337 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3BP20337 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms