Protein–RNA interactions for Protein: P15954

COX7C, Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX7CP15954 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX7CP15954 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
COX7CP15954 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
COX7CP15954 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX7CP15954 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX7CP15954 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX7CP15954 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX7CP15954 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX7CP15954 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX7CP15954 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX7CP15954 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX7CP15954 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX7CP15954 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX7CP15954 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
COX7CP15954 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX7CP15954 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX7CP15954 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX7CP15954 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX7CP15954 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX7CP15954 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX7CP15954 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX7CP15954 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
COX7CP15954 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX7CP15954 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX7CP15954 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX7CP15954 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX7CP15954 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX7CP15954 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX7CP15954 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX7CP15954 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX7CP15954 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX7CP15954 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX7CP15954 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX7CP15954 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX7CP15954 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX7CP15954 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX7CP15954 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX7CP15954 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX7CP15954 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX7CP15954 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX7CP15954 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX7CP15954 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX7CP15954 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX7CP15954 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX7CP15954 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX7CP15954 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX7CP15954 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX7CP15954 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX7CP15954 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX7CP15954 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX7CP15954 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX7CP15954 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX7CP15954 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX7CP15954 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX7CP15954 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX7CP15954 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX7CP15954 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX7CP15954 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX7CP15954 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX7CP15954 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX7CP15954 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX7CP15954 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX7CP15954 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX7CP15954 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX7CP15954 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX7CP15954 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX7CP15954 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX7CP15954 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX7CP15954 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX7CP15954 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX7CP15954 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX7CP15954 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX7CP15954 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX7CP15954 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX7CP15954 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX7CP15954 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX7CP15954 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX7CP15954 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX7CP15954 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX7CP15954 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
COX7CP15954 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX7CP15954 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX7CP15954 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX7CP15954 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX7CP15954 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX7CP15954 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
COX7CP15954 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX7CP15954 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
COX7CP15954 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms