Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
VEGFAP15692 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
VEGFAP15692 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
VEGFAP15692 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
VEGFAP15692 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
VEGFAP15692 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms