Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSF2RAP15509 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CSF2RAP15509 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CSF2RAP15509 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CSF2RAP15509 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSF2RAP15509 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CSF2RAP15509 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSF2RAP15509 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSF2RAP15509 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CSF2RAP15509 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSF2RAP15509 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSF2RAP15509 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CSF2RAP15509 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CSF2RAP15509 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSF2RAP15509 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSF2RAP15509 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSF2RAP15509 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSF2RAP15509 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CSF2RAP15509 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CSF2RAP15509 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CSF2RAP15509 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSF2RAP15509 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSF2RAP15509 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CSF2RAP15509 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSF2RAP15509 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSF2RAP15509 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms