Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM49P0CI25 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM49P0CI25 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM49P0CI25 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM49P0CI25 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms