Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGFRP08138 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGFRP08138 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGFRP08138 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGFRP08138 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGFRP08138 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NGFRP08138 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGFRP08138 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGFRP08138 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGFRP08138 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGFRP08138 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGFRP08138 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGFRP08138 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NGFRP08138 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGFRP08138 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGFRP08138 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGFRP08138 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGFRP08138 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGFRP08138 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGFRP08138 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGFRP08138 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGFRP08138 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGFRP08138 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGFRP08138 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NGFRP08138 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGFRP08138 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGFRP08138 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGFRP08138 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGFRP08138 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGFRP08138 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGFRP08138 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGFRP08138 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGFRP08138 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGFRP08138 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGFRP08138 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGFRP08138 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGFRP08138 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGFRP08138 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGFRP08138 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGFRP08138 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGFRP08138 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NGFRP08138 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGFRP08138 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGFRP08138 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NGFRP08138 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGFRP08138 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGFRP08138 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGFRP08138 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGFRP08138 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGFRP08138 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGFRP08138 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGFRP08138 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGFRP08138 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NGFRP08138 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NGFRP08138 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGFRP08138 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGFRP08138 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NGFRP08138 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGFRP08138 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGFRP08138 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGFRP08138 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGFRP08138 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGFRP08138 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NGFRP08138 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGFRP08138 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGFRP08138 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGFRP08138 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGFRP08138 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGFRP08138 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NGFRP08138 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGFRP08138 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGFRP08138 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGFRP08138 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NGFRP08138 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NGFRP08138 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGFRP08138 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGFRP08138 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGFRP08138 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGFRP08138 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGFRP08138 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGFRP08138 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGFRP08138 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NGFRP08138 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGFRP08138 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGFRP08138 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NGFRP08138 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGFRP08138 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGFRP08138 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NGFRP08138 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGFRP08138 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGFRP08138 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NGFRP08138 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NGFRP08138 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NGFRP08138 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NGFRP08138 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NGFRP08138 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NGFRP08138 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NGFRP08138 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NGFRP08138 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NGFRP08138 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms