Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARHGEF9O43307 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ARHGEF9O43307 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms