Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QQQ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QQQ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QQQ9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QQQ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
J3QQQ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QQQ9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QQQ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QQQ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QQQ9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QQQ9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QQQ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
J3QQQ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3QQQ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3QQQ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3QQQ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3QQQ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
J3QQQ9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3QQQ9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3QQQ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
J3QQQ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3QQQ9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3QQQ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
J3QQQ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QQQ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QQQ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QQQ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QQQ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QQQ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QQQ9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QQQ9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
J3QQQ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QQQ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QQQ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QQQ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QQQ9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QQQ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
J3QQQ9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QQQ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QQQ9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QQQ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QQQ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
J3QQQ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3QQQ9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3QQQ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3QQQ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
J3QQQ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3QQQ9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3QQQ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
J3QQQ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
J3QQQ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3QQQ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3QQQ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
J3QQQ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3QQQ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3QQQ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
J3QQQ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QQQ9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QQQ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QQQ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QQQ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QQQ9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QQQ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
J3QQQ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QQQ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
J3QQQ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QQQ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17■□□□□ 0.31
J3QQQ9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QQQ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QQQ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
J3QQQ9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QQQ9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QQQ9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QQQ9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QQQ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QQQ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QQQ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QQQ9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
J3QQQ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QQQ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QQQ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QQQ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QQQ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
J3QQQ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
J3QQQ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
J3QQQ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
J3QQQ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
J3QQQ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
J3QQQ9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
J3QQQ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
J3QQQ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
J3QQQ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
J3QQQ9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
J3QQQ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
J3QQQ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
J3QQQ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3QQQ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3QQQ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3QQQ9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
J3QQQ9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms