Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC160A6NGH7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC160A6NGH7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC160A6NGH7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC160A6NGH7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms