Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYNDIG1LA6NDD5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYNDIG1LA6NDD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNDIG1LA6NDD5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYNDIG1LA6NDD5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms