Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WVE0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WVE0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
A0A087WVE0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A0A087WVE0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A0A087WVE0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms