Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SEC24CP53992 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SEC24CP53992 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms